Moleculaire biologie: Chapter 12: Transcription activators in Eukaryotes



Dovnload 5.57 Mb.
Pagina3/10
Datum07.11.2017
Grootte5.57 Mb.
1   2   3   4   5   6   7   8   9   10

The GAL 4 protein


Het GAL 4 proteïne is een activator in gist, dat de expressie van genen controleert die instaan voor het metabolisme van galactose. Elk van deze genen die reageert op de aanwezigheid van van GAL4 hebben een sequentie die erdoor herkend kan worden (enhancer), die upstream van de startplaats gelegen is. Deze sequenties worden upstream activating sequences genoemd. GAL4 zal aan deze sequenties binden als een dimeer.Het DNA bindend motief is gelegen in de eerste 40 AZ van het proteïne; de dimerisatie site is gevonden in de residu’s 50-94. Het DNA bindend domein is vergelijkbaar met de zink vingers in het feit dat het ook zink-ionen en cysteïne residus bevat. De structuur is echter zeer verschillend: elk motief heeft 6 cysteïnes en bevatten geen histidines. De verhouding zink ionen tot het aantal cysteïnes bedraagt 1:3.

The DNA binding motif

Onderstaande figuur geeft de structuur van het GAL4 dimeer DNA complex weer. Elk monomeer bevat een domein dat in staat is om DNA te binden, waarin de cysteïne residu’s 2 zink-ionencomplexeren. Door complexatie wordt wordt een bimetaal thiolaat cluster gevormd. Deze motieven kunnen een α helix vormen die specifieke interacties met het DNA kan aangaan. Het andere uiteinde van het monomeer dient voor de dimerisatie.



The dimerisation motif

GAL4 monomeren maken ook gebruik van α helices om dimeren te vormen; Deze helices vormen een parallelle gespilaliseerde spiraal (coiled coil), zoals weergegeven in bovenstaande figuur B en C. De dimerisatie van de α helices treedt op ter hoogte van de kleine groef van het DNA. De DNA bindings site en de dimerisatie site van beide monomeren worden met elkaar verbonden door een linker sequentie.




    1. Deel met je vrienden:
1   2   3   4   5   6   7   8   9   10


De database wordt beschermd door het auteursrecht ©tand.info 2017
stuur bericht

    Hoofdpagina